طراحی پرایمرهای اختصاصی برای مطالعه تنوع تک نوکلئوتیدی (snp) در ژن ها و تعیین عملکرد آنها
Authors
abstract
اطلاعات زیادی در مورد توالی بسیاری از ژنها بدون آنکه عملکرد این توالیها شناخته شده باشد، وجود دارد. از این رو تحقیقات فراوانی از طریق روشهای ژنتیکی معکوس برای پر کردن شکاف بین ساختار و عملکرد این توالیها انجام گرفته است. بدین منظور آزمایشی با هدف چگونگی طراحی پرایمرهای اختصاصی ژن، که بتوانند تنوع تک نوکلئوتیدی و تاثیر آن بر عملکرد ژن را تعیین نمایند، در مرکز بین المللی تحقیقات کشاورزی در مناطق خشک (icarda) انجام گرفته است. ژنهای مورد بررسی در این آزمایش دو ژن متحمل به تنش شوری در جو، cbl4 و hvhkt1، بوده است و هشت جفت پرایمر برای این دو ژن طراحی گردید. کارآیی پرایمرها برای تکثیر منطقه مورد نظر و نشان دادن تنوع تک نوکلئوتیدی از طریق واکنش زنجیرهای پلیمراز1 و توالی یابی قطعات تکثیری مورد ارزیابی قرار گرفت. همه پرایمرهای طراحی شده دارای قابلیت بالایی از نظر تکثیر قطعات ژنومی مربوط و تعیین تنوع تک نوکلئوتیدی بودند. این پرایمرها اختصاصی بوده و از مناطق کدکننده ژن طراحی شدند. لذا به کمک آنها میتوان نقش تنوع نوکلئوتیدی موجود بین ژنوتیپهای مختلف در تغییر عملکرد ژن را مورد مطالعه قرار داد. همچنین انتخاب به کمک این مارکرهای اختصاصی دارای کارآیی بیشتری نسبت به انتخاب بر اساس مارکرهای پیوسته با ژن میباشد.
similar resources
طراحی پرایمرهای اختصاصی برای مطالعه تنوع تک نوکلئوتیدی (SNP) در ژن ها و تعیین عملکرد آنها
There is a lot of information about genes sequence but their functions are still unknown. So, to fill the gap between structure and function of these sequences many reverse genetic researches have been done. Current experiment studying, how to design gene-specific primers, that can determine single nucleotide diversity and its impact on gene function.This research was condacted at International...
full textشناسایی پلی‌مورفیسم‌های تک نوکلئوتیدی (SNP) مؤثر در تشخیص چهره و جمجمه
زمینه و هدف: در سال‌های اخیر تکنیک‌های جدیدی برای تشخیص چهره و ساختار جمجمه، با روشهای ژنتیکی مولکولی، برای استفاده در موارد قانونی و جنایی پیشنهاد شده است که بررسی خصوصیات فردی، همچون رنگ چشم، مو و پوست را میسر ساخته است. فناوری تشخیص چهره با DNA، به بررسی مارکرهای مولکولی مؤثر در تشخیص چهره و جمجمه با استفاده از فناوری‌های تعیین توالی کل یا بخشی از ژنوم می‌پردازد. روش بررسی: برای تشخیص اند...
full textتعیین توالی و جهش‌های تک نوکلئوتیدی پروموتور و ژن پروتئین شوک حرارتی ۷۰ مرغ‌های بومی خوزستان
پروتئین شوک حرارتی ۷۰ یک چاپرون است که در پاسخ به استرس بیان می‌شود. هدف از این تحقیق تعیین توالی و جهش‌های تک نوکلئوتیدی پروموتور و ژن پروتئین شوک حرارتی ۷۰ و بررسی اثر جهش‌های تک نوکلئوتیدی بر ساختار سه بعدی و عملکرد پروتئین شوک حرارتی ۷۰ مرغ بومی استان خوزستان با استفاده از روشهای بیوانفورماتیکی بود. جهت انجام این تحقیق از ۲۰ قطعه مرغ بومی از مناطق مختلف استان خوزستان خونگیری انجام ش...
full textطراحی پرایمرهای اختصاصی برای نشان دادن ژنهای exoA، oprL و algD برای تشخیص سریع سویه‌های سودوموناس آئروژینوزا در نمونه‌های بالینی
Background: The aim of this study was compared the efficacy of the designed primers and already published primers for detection of the exoA, oprL and algD genes by PCR assay for finding a rapid, accurate and highly sensitive and specific procedure to detect the Pseudomonas aeruginosa in the serious and fatal infections such as cystic fibrosis disease, burned individual.Methods: A total of 150...
full textشناسایی پلی مورفیسم های تک نوکلئوتیدی (snp) در پروموتر ژن مهارکنندهnf-kb (ikb-alpha) در بیماران مبتلا به مالتیپل اسکلروز
مالتیپل اسکلروز (ms) یکی از شایع ترین بیماری های خودایمنی است که سیستم عصبی مرکزی را درگیر می کند.تاکنون علت اصلی این بیماری شناخته نشده است اما مطالعات اپیدمیولوژیکی به روشنی نشان می دهد که هم عوامل محیطی و هم عوامل ژنتیکی در ابتلا به این بیماری دخالت دارند. هدف از این تحقیق بررسی ارتباط یک سری پلی مورفیسم های تک نوکلئوتیدی موجود در پروموتر ژن مهار کننده nf-?bکه مهمترین آن ikb-? می...
15 صفحه اولشناسایی چندشکلی تک نوکلئوتیدی در ژن گیرندة ملانوکورتین-1 (MC1R) در گوسفند لری بختیاری
گیرندة ملانوکورتین-1 که توسط جایگاه گسترش کد می‌شود، نقش مهمی در تنوع رنگ پوشش در دام‌های اهلی بازی می‌کند. در این بررسی، قطعه‌ای به طول840 جفت باز از ناحیة 5َ کناری و قسمت اعظم توالی کدکنندة ژن MC1R گوسفندی در پانزده رأس گوسفند لری بختیاری با فنوتیپ متفاوت تعیین توالی شد. نتایج تعیین توالی شمار هشت چندشکلی تک نوکلئوتیدی را نشان داد که شامل پنج جهش هم‌معنی (c.464G.A, c.557G>C, c.635c>T, c.692C>T...
full textMy Resources
Save resource for easier access later
Journal title:
پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعیجلد ۷، شماره ۱۶، صفحات ۱۳۰-۱۳۸
Keywords
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023